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統合データベース講習会:AJACSみちのく2poster_ajacs34

統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する講習会です。
今回の講習会では、1日目は生命科学系データベースのカタログ、横断検索、アーカイブの使い方や生命科学系の主要なデータベース(DDBJ:DNA Data Bank of Japan、PDBj:Protein Data Bank Japan、KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)の使い方について、また、Cytoscapeの使い方を紹介します。2日目はRおよびBioconductorを使った次世代シークエンサデータの解析のほか、遺伝子発現データベースや解析ツールをご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。

 

  • 対象: 生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方。
  • 日時: 2012年8月23日(木) 13:00~18:00、8月24日(金) 9:00~16:30
  • 会場: 東北大学星陵地区IT教育施設 (医学部4号館6階)【アクセス】
  • 定員: 50名
  • 費用: 無料
  • PC:  会場備え付けのwindows PCが利用可能です。PCの持込みも可能です。
         ※PCを持ち込む場合、無線LANに接続できるPC環境とEAST IDが必要です。
  • 申込: 申し込み受付は終了しました。たくさんのお申し込みありがとうございました。

 

  • プログラム  講習資料はこちらのサイトをご覧ください。

8月23日(木)
13:00~14:30 「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」 大波純一 (科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター)
14:30~14:45 休憩
14:45~16:15 「主要なDB(DDBJ、PDBj、KEGG)の使い方」 河野信 (情報・システム研究機構 ライフサイエンス総合データベースセンター)
16:15~16:30 休憩
16:30~18:00 「Cytoscapeを使ったデータの可視化」 櫛田達矢 (科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター)

8月24日(金)
9:00~12:00 「R+Bioconductorを使ったNGS解析」 二階堂愛 (理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター)
12:00~13:30 昼食
13:30~16:30 「遺伝子発現DB・解析ツールの紹介」 仲里猛留 (情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター)

 

  • お問い合わせ: 統合データベース講習会事務局  までメールにてお問い合わせください。

 

  • 主催 科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)
  • 共催 東北大学大学院医学系研究科
         大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構
                         ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)

 

 

※AJACS(「あじゃっくす」と発音)とは・・・
ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター(Annotator)、キュレーター(Curator)、システムデータベース管理者(System DB administrator)の総称です(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator)。AJACSな人は、統合データベースの作成、維持、管理にかかわる新たな職種です。
文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」(平成18年度~平成22年度)においては、主としてライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS: Database Center for Life Science)を担う人材として期待されてきました。平成23年度からは講習会等も新たな体制で実施されることになり、より幅広く活躍できるAJACSが生まれることを願っています。