
統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する講習会です。
今回の講習会では、1日目は生命科学系データベースのカタログ、横断検索、アーカイブの使い方や生命科学系の主要なデータベース(DDBJ:DNA Data Bank of Japan、PDBj:Protein Data Bank Japan、KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)の使い方について、また、Cytoscapeの使い方を紹介します。2日目はRおよびBioconductorを使った次世代シークエンサデータの解析のほか、遺伝子発現データベースや解析ツールをご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。
8月23日(木)
13:00~14:30 「NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス」 大波純一 (科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター)
14:30~14:45 休憩
14:45~16:15 「主要なDB(DDBJ、PDBj、KEGG)の使い方」 河野信 (情報・システム研究機構 ライフサイエンス総合データベースセンター)
16:15~16:30 休憩
16:30~18:00 「Cytoscapeを使ったデータの可視化」 櫛田達矢 (科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター)
8月24日(金)
9:00~12:00 「R+Bioconductorを使ったNGS解析」 二階堂愛 (理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター)
12:00~13:30 昼食
13:30~16:30 「遺伝子発現DB・解析ツールの紹介」 仲里猛留 (情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター)
※AJACS(「あじゃっくす」と発音)とは・・・
ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター(Annotator)、キュレーター(Curator)、システムデータベース管理者(System DB administrator)の総称です(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator)。AJACSな人は、統合データベースの作成、維持、管理にかかわる新たな職種です。
文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」(平成18年度~平成22年度)においては、主としてライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS: Database Center for Life Science)を担う人材として期待されてきました。平成23年度からは講習会等も新たな体制で実施されることになり、より幅広く活躍できるAJACSが生まれることを願っています。