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統合データベース講習会:AJACS富山AJACS富山ポスター

統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する講習会です。
今回の講習会は、生命科学系データベースのカタログ、横断検索、アーカイブの使い方に加えて、次世代シーケンサデータの実際の解析例や次世代シーケンスデータベース Sequence Read Archive、次世代シーケンス解析パイプライン DDBJ Read Annotation Pipeline の使い方、また生命科学データの可視化ツール Cytoscape の使い方を中心にご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。

 

  • 対象: 生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方。
  • 日時: 2013年8月30日(金) 10:00~17:30
  • 定員: 約50名
  • 費用: 無料
  • PC:  会場備え付けのPC(Windows)をご使用いただきます。
  • 申込: 申し込み受付は終了しました。たくさんのご応募ありがとうございました。

 

  • プログラム  講習資料はこちらのサイトをご覧ください。

10:00~10:20 「データベースの統合はなぜ必要か?」
           / 高木利久(東京大学大学院 新領域創成科学研究科/科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
             / 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 DDBJセンター)
10:20~11:20 「NBDCとNBDCが提供するサービス」 / 櫛田達矢(科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター)
11:20〜11:30 休憩
11:30~12:30  「次世代シーケンサーを用いたHLA遺伝子の配列決定」
           / 細道一善 (情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所人類遺伝研究部門)
12:30~13:40 昼食
13:40~14:40 「次世代シーケンスデータベースSequence Read Archiveを利用する」
           / 大田達郎(情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター)
14:40〜14:50 休憩
14:50〜15:50  「DDBJと新型シーケンサ解析パイプラインの使い方」
           / 中村保一(情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所/ 大量遺伝情報研究室)
15:50〜16:00 休憩
16:00〜17:30 「Cytoscapeを使ったデータの可視化」 / 櫛田達矢(科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター)

 

  • お問い合わせ: 統合データベース講習会事務局  までメールにてお問い合わせください。

 

  • 主催: 科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)
  • 共催: 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
            富山大学生命科学先端研究センター
            日本DNAデータバンク(DDBJ)

 

 

※AJACS(「あじゃっくす」と発音)とは・・・
ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材、アノテーター(Annotator)、キュレーター(Curator)、システムデータベース管理者(System DB administrator)の総称です(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator)。AJACSな人は、統合データベースの作成、維持、管理にかかわる新たな職種です。
文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」(平成18年度~平成22年度)においては、主としてライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS: Database Center for Life Science)を担う人材として期待されてきました。平成23年度からは講習会等も新たな体制で実施されることになり、より幅広く活躍できるAJACSが生まれることを願っています。