演題詳細
| タ イ ト ル： | 「創薬・疾患研究のためのデータベース開発と統合： 医薬基盤研究所における取り組み」 |
| 発 表 者： | 水口 賢司 |
| 所 属 ： | 医薬基盤研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト プロジェクトリーダー |
| 発 表 資 料 ： | 講演スライド  ※発表資料の著作権は、別途記載がない限り発表者／所属機関に帰属します。 ポスター・スライド内の図や文言を転用する際には、著作者と話し合っていただくようお願いいたします。 |
| 要 旨 ： | 創薬・疾患研究においては、ターゲット探索と検証、リード化合物の同定と最適化、安全性の確認などのあらゆるプロセスにおいて、多様な情報を統合したデータベースを活用することが、より効率的な医薬品開発につながると期待されている。医薬基盤研究所では、創薬支援情報の集積拠点となるべく、データベース開発やデータ統合の方法開発と応用を行なっている。本講演では、安全性バイオマーカー探索のためのトキシコゲノミクスデータベース１）やアジュバントデータベース２）などの個々のデータベースの紹介と共に、セマンティックウェブ技術を利用したデータ統合の試みについて報告する。さらに、セマンティックウェブとは異なる技術を用いて、遺伝子、タンパク質から化合物、疾患関連データを統合したデータウェアハウスTargetMine３、４）の有効性について、幾つかの新規創薬ターゲット発見に向けた具体的な実験検証を含めて示す５、６）。また、バイオサイエンスデータベースセンターとの共同研究による医学・生命科学データベース一括横断検索システムSagace７）についても紹介する。 参考文献 (website URL) 1）. http://toxico.nibio.go.jp/ 2）. http://adjuvantdb.nibio.go.jp/ 3）. http://targetmine.nibio.go.jp/ 4）. Chen Y-A, Tripathi LP, Mizuguchi K (2011) TargetMine, an Integrated Data Warehouse for Candidate Gene Prioritisation and Target Discovery. PLoS ONE 6(3): e17844. 5）. Tripathi LP, et al. (2010) Network based analysis of hepatitis C virus Core and NS4B protein interactions. Mol Biosyst 6: 2539-2553. 6）. Tripathi LP, et al. (2012) Proteomic Analysis of Hepatitis C Virus (HCV) Core Protein Transfection and Host Regulator PA28γ Knockout in HCV Pathogenesis: A Network-Based Study. J Proteome Res. 11: 3664-3679. 7）. http://sagace.nibio.go.jp/ |
